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掌理急性、慢性、蟲媒及新興傳染病之防治等事項,共分4股如下:
掌理醫事機構及醫事人員管理、緊急醫療救護、山地醫療保健、市立醫院及衛生所管理等事項,共分4股如下:
掌理心理健康促進諮商重建、自殺防治、物質濫用防制、毒癮減害、精神衛生醫療復健及家性暴加害人處遇之精神心理防治等事項,共分3股如下:
掌理藥事人員、藥事機構、藥物及化妝品管理與稽查等事項,共分3股如下:
掌理食品、食品業及餐飲業之衛生管理等事項,共分3股如下:
掌理婦幼健康、中老年病防治、癌症防治、健康促進、營業衛生、職業衛生及外籍勞工健康檢查審核等事項,共分4股如下:
掌理長期照護業務之規劃、推展、監督、考核及失能個案照顧管理等事項,共分5股如下:
掌理食品、藥物、水質及公共衛生檢驗等事項,共分3股如下:
掌理研究發展、管制考核、國際衛生事務、衛生志工、學生實習及資訊管理等事項,共分3股如下:
掌理文書、印信、檔案、出納、採購發包、事務管理、財務管理等事項,共分2股如下:
依法辦理歲計、會計及統計事項,共分3股如下:
依法辦理人事管理事項,共分2股如下: